Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GATA4P43694 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms