Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER2P43116 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms