Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms