Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDIT3P35638 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms