Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA4P35212 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA4P35212 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA4P35212 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJA4P35212 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms