Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTF4P34130 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF4P34130 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF4P34130 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms