Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA7P31268 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA7P31268 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA7P31268 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA7P31268 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms