Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms