Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM5AP29375 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms