Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms