Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCNA2P20248 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms