Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms