Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF3P18847 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF3P18847 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF3P18847 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms