Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD8P13378 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms