Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH3P11055 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH3P11055 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH3P11055 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH3P11055 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH3P11055 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYH3P11055 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYH3P11055 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYH3P11055 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYH3P11055 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYH3P11055 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYH3P11055 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYH3P11055 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH3P11055 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH3P11055 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms