Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHGAP10645 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHGAP10645 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHGAP10645 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHGAP10645 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHGAP10645 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHGAP10645 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHGAP10645 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms