Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CGB3P0DN86 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms