Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms