Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-AP01891 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms