Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24BO95487 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms