Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG12O94817 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG12O94817 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG12O94817 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG12O94817 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms