Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXNC1O60486 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNC1O60486 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms