Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms