Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms