Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCAO15360 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCAO15360 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms