Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNMO15061 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNMO15061 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNMO15061 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNMO15061 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNMO15061 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNMO15061 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNMO15061 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNMO15061 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms