Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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