Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIP1O00291 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms