Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms