Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD3A6NKT7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms