Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms