Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms