Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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HECTD4Q9Y4D8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HECTD4Q9Y4D8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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