Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms