Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms