Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms