Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL13Q9P2N7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms