Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms