Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CALCOCO1Q9P1Z2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CALCOCO1Q9P1Z2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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CALCOCO1Q9P1Z2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CALCOCO1Q9P1Z2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CALCOCO1Q9P1Z2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CALCOCO1Q9P1Z2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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