Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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GDE1Q9NZC3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GDE1Q9NZC3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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