Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL28Q9NXS3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms