Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms