Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMSN1Q9NSI8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms