Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC6A13Q9NSD5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms