Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms