Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT84Q9NSB2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms