Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms