Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1549Q9HCM3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms