Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ROBO2Q9HCK4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROBO2Q9HCK4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms