Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms